工事費内訳書の様式を入札情報サービスからダウンロードしたのですが、そのファイル名は変更してもいいのでしょうか？

工事費内訳書のファイル名に関しては、特に発注機関から指定がない場合は、 自由に変更していただいて構いません。
その他の添付ファイルに関しても同様です。
但し、ファイル名が長すぎるとシステムに添付できなくなりますので、 ファイル名の指定が無い場合は区別がつく範囲で短めにお願いします。

なお、添付できるファイル名の長さはパス名を含めて260文字以内です。
下記の例の場合、パス名を含めたファイル名は45文字になります。

C:\Users\(ﾕｰｻﾞｰ名)\Desktop\(ﾌｫﾙﾀﾞ名)\(ﾌｧｲﾙ名).xlsx